Cyanidioschyzon merolae Genome Project

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c03f0001   353478  AACAAAAGCTTTTATGCCAGTCTCTGTTCAACGGCTGTGTTGCTGCGCTTAAGCCCTAAC  353537
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c03f0001   353538  A-GGGATCACTGACTCGTGATCCTGGGTAGACTCCGTTCAAGACGTACCTTGCCGTGGGG  353596
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sz72n19    307     ............................................................  366
sz44o16    360     ............................................................  419
sz6j03     324     ............................................................  383
sz83f11    335     ............................................................  394
sz17a04    335     ............................................................  394
sz38f11    347     ...........................G................................  406
sz57k14    347     ............................................................  406
sz31a22    331     ............................................................  390
sz98n05    338     ............................................................  397
sz19c06    347     ............................................................  406
sz26d13    347     ............................................................  406
sz32o16    360     ............................................................  419
sz53c21    335     ............................................................  394
sz54d05    376     ...................................G........................  435
sz9b09     334     ............................................................  393
sz55d19    335     ............................................................  394
sz15p02    342     ............................................................  401
sz34d08    324     ............................................................  383
sz18d09    372     ............................................................  431
sz4p01     335     ............................................................  394
sz6f04     335     ............................................................  394
sz41k19    347     ............................................................  406
sz63l03    341     ...........................G................................  400
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sz23l01    347     ............................................................  406
sz11m23    335     ...............................N............................  394
sz22c20    358     ............................................................  417
sz36e02    323     ...................N...........N.......................N....  382

c03f0001   353897  TTTGCCGATCGAAGGCTTACCTGAATTTCGCTCCCTGTCAGCTCGCCTCGTATTTGGGGA  353956
sz58o07    402     ............................................................  461
sz59b10    407     ............................................................  466
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sz6j03     384     ............................................................  443
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sz17a04    395     ............................................................  454
sz38f11    407     ............................................................  466
sz57k14    407     ............................................................  466
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sz53c21    395     ............................................................  454
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sz15p02    402     ......T.....................................................  461
sz34d08    384     ............................................................  443
sz18d09    432     ............................................................  491
sz4p01     395     ............................................................  454
sz6f04     395     ...........................................N................  454
sz41k19    407     ................................T...........................  466
sz63l03    401     ............................................................  460
sz28j14    407     ............................................................  466
sz23l01    407     .......................................G....................  466
sz11m23    395     ..........................C.................................  454
sz22c20    418     ...............................                               448
sz36e02    383     .............N...............N....................N...N.....  442

c03f0001   353957  GCGCTCACCGGCGCTCAAAGAGCAGCGAGTTGTCTCGCTACAAAGCCTGTCGGGAACAGG  354016
sz58o07    462     ............................................................  521
sz59b10    467     ............................................................  526
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sz59b15    467     ............................................................  526
sz70c20    467     ............................................................  526
sz40k05    452     ............A...............................................  511
sz43i02    455     ............................................................  514
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sz72n19    427     ............................................................  486
sz44o16    480     ............................................................  539
sz6j03     444     ............................................................  503
sz83f11    455     ............................................................  514
sz17a04    455     ............................................................  514
sz38f11    467     ............................................................  526
sz57k14    467     ............................................................  526
sz31a22    451     ............................................................  510
sz98n05    458     ............................................................  517
sz19c06    467     ............................................................  526
sz26d13    467     ............................................................  526
sz32o16    480     ............................................................  539
sz53c21    455     ............................................................  514
sz54d05    496     ............................................................  555
sz9b09     454     ............................................................  513
sz55d19    455     ............................................................  514
sz15p02    462     ............................................................  521
sz34d08    444     ............................................................  503
sz18d09    492     ............................................................  551
sz4p01     455     ............................................................  514
sz6f04     455     ..........................................................N.  514
sz41k19    467     ........................N...........................          518
sz63l03    461     ...................................................           511
sz28j14    467     .....................................                         503
sz23l01    467     .......................                                       489
sz11m23    455     ...................N.N..N.N.........N.......NN.....           505

c03f0001   354017  CTCGCTTCGCCTGGTCGCAGAGTTCCTCAGCAAGTTTTACCAGCGCGGCGCAGTCTGTTA  354076
sz58o07    522     ............................................................  581
sz59b10    527     ............................................................  586
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sz59b15    527     ............................................................  586
sz70c20    527     ............................................................  586
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sz43i02    515     ............................................................  574
sz61n18    515     .............................A..............................  574
sz72n19    487     ............................................................  546
sz44o16    540     ............................................................  599
sz6j03     504     ............................................................  563
sz83f11    515     ............................................................  574
sz17a04    515     ............................................................  574
sz38f11    527     ............................................................  586
sz57k14    527     ............................................................  586
sz31a22    511     ............................................................  570
sz98n05    518     ............................................................  577
sz19c06    527     .........................................................     583
sz26d13    527     .....................................................         579
sz32o16    540     .....................................                         576
sz53c21    515     ...................................................           565
sz54d05    556     .....................                                         576
sz9b09     514     ...........................................                   556
sz55d19    515     .......................................                       553
sz15p02    522     ..........................................                    563
sz34d08    504     .....................................                         540
sz4p01     515     .....................                                         535
sz6f04     515     ......                                                        520

c03f0001   354077  TCTGCCGCGCCCGACCTGGGGGAACCACTGGAACATATTCCCAGCGGCGGGCATAAAGTG  354136
sz58o07    582     ............................................................  641
sz59b10    587     ............................................................  646
sz14e11    587     .......................................................       641
sz59b15    587     .......................................................       641
sz70c20    587     ................................................              634
sz40k05    572     ............................................................  631
sz43i02    575     ..........................................................    632
sz61n18    575     ..................................................            624
sz72n19    547     ............................................................  606
sz44o16    600     ...............                                               614
sz6j03     564     .................................................             612
sz83f11    575     .........................                                     599
sz17a04    575     .........................                                     599
sz38f11    587     .......                                                       593
sz57k14    587     ..                                                            588
sz31a22    571     ...............                                               585
sz98n05    578     .........................                                     602

c03f0001   354137  CCGCGAGTACCGGTATTACTCAGACGAGACCCATGAGGTCGACATCATCGGTCTCCTGGA  354196
sz58o07    642     ...................                                           660
sz59b10    647     ..........                                                    656
sz40k05    632     ........                                                      639
sz72n19    607     ...................                                           625

c03f0001   354197  CGACCTAACTGCTGCACCGTCGGGCTCAATCGTGCTCCTTCACGCGTGTGCACATAATCC  354256
rsz59b15   790                                                   ..............  777
rsz40k05   790                                                   ..............  777
rsz26d13   773                                                   ..............  760
rsz15e13   790                                                   ..N...........  777
rsz43i02   770                                                   ..............  757
rsz14e11   774                                                    .............  762
rsz57k14   774                                                    .............  762

c03f0001   354257  GACGGGAGCAGACCCTTCC-ATGACACAGTGGCAAGAGATCTTGGACGTCATCC-G-AAA  354313
rsz59b15   776     ..............N....C..................................-.-...  719
rsz40k05   776     ..............N....C..................................-.-...  719
rsz26d13   759     ...................C..................................-.-...  702
rsz15e13   776     ..............N....C..................................-.-...  719
rsz43i02   756     ..............N....-..................................-.-...  700
rsz14e11   761     ...................C..................................-.-...  704
rsz57k14   761     ..............N....C..................................C.-...  703
rsz44o16   755                       .-..................................-.-...  717
rsz11m23   747         ..........N....-..................................-.-...  695
rsz54d05   750        ...........N....-..................................-.-...  697
rsz59b10   735                                                 ..........-.A...  721
rsz9b09    730                                                     ......-.-...  721
rsz53c21   724                                                         ..-.-...  719
rsz15p02   713                                           ................-.-...  694
rsz70c20   718                                                ...........-.-...  704
rsz6j03    717                                                ...........-.-...  703
rsz98n05   703                                                     ......-.-...  694
rsz31a22   712                                                          .-.-...  708
rsz58o07   702                                                      .....-.-.G.  694

c03f0001   354314  GAAACAACATTTTCCGTTATTTGACTGCGCTTACCAAGGCTTCGCCTCGGGCTCTTTTGA  354373
rsz59b15   718     ............................................................  659
rsz40k05   718     ............................................................  659
rsz26d13   701     ............................................................  642
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rsz43i02   699     ............................................................  640
rsz14e11   703     ..G.........................................................  644
rsz57k14   702     ............................................................  643
rsz44o16   716     ............................................................  657
rsz11m23   694     ............................................................  635
rsz54d05   696     ............................................................  637
rsz59b10   720     ............................................................  661
rsz9b09    720     ............................................................  661
rsz53c21   718     ............................................................  659
rsz15p02   693     ............................................................  634
rsz70c20   703     ............................................................  644
rsz6j03    702     ............................................................  643
rsz98n05   693     ............................................................  634
rsz31a22   707     ............................................................  648
rsz58o07   693     ............................................................  634
rsz72n19   682                                         ........................  659
rsz36e02   675                              ...................................  641
rsz38f11   665                               ..................................  632
rsz6f04    685        .........................................................  629
rsz34d08   666                                                     ............  655
rsz86a10   668                                                     ...A........  657
rsz4p01    665                                                         ........  658
rsz61n18   664                                                          .......  658
rsz81o13   659                                                        .........  651
rsz76f20   656                                                            .....  652
rsz32o16   652                                                             ....  649
rsz55d19   647                                                            .....  643
rsz93o07   644                                                        .........  636
rsz23l01   631                                                           ......  626
rsz18d09   633                                                                .  633
rsz22c20   635                                                      ...........  625
rsz75j15   632                                                           ......  627
rsz63l03   626                                                         ........  619

c03f0001   354374  GCGCGATGCGGCAGCTGTTCGCTTGTTTGAACGCGCTACAGTACCGGCTTCCGAAGCGGA  354433
rsz59b15   658     ............................................................  599
rsz40k05   658     ............................................................  599
rsz26d13   641     ............................................................  582
rsz15e13   658     ............................................................  599
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rsz41k19   607                                          .......................  585
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rsz15e11   597           .............................................N........  544
rsz11g03   586                                          .......................  564

c03f0001   354434  TGGTGCCAGAGAGCGACCCATGGAGATGGCGGTGACGCAGTCGTTTGCGAAAAATATGGG  354493
rsz59b15   598     ............................................................  539
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rsz61n18   597     ....................................A.......................  538
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rsz83f11   600     ............................................................  541
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rsz22c20   564     ...........................................................A  505
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rsz63l03   558     ............................................................  499
rsz41k19   584     ............................................................  525
rsz22a01   564     ............................................................  505
rsz15e11   543     ............................................................  484
rsz11g03   563     .................................N..........................  504

c03f0001   354494  ACTTTACGGAGAGCGCGTCGGCGCAGCTCATATTGTCTGTGCTGCTCCGGCAGTAACGCA  354553
rsz59b15   538     ............................................................  479
rsz40k05   538     ............................................................  479
rsz26d13   521     ............................................................  462
rsz15e13   538     ............................................................  479
rsz43i02   519     ............................................................  460
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rsz11m23   514     ............................................................  455
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rsz9b09    540     ............................................................  481
rsz53c21   538     ............................................................  479
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rsz72n19   538     ............................................................  479
rsz36e02   520     G...........................................................  461
rsz38f11   511     ............................................................  452
rsz6f04    508     .............................G..............................  449
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rsz83f11   540     ............................................................  481
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rsz18d09   513     ............................................................  454
rsz22c20   504     ............................................................  445
rsz75j15   506     ............................................................  447
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rsz41k19   524     ............................................................  465
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rsz15e11   483     ............................................................  424
rsz11g03   503     .............N...........................N..................  444
rsz28j14   451                                                            .....  447

c03f0001   354554  AGCCGTGCTCAGCCAAATGAAGCAGATAGCGCGCGGGCTCTATTCGAGTCCA-CCGGCAC  354612
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rsz22a01   444     ....................................................-.......  386
rsz15e11   423     ....................................................-.......  365
rsz11g03   443     ..................N.................................-.......  385
rsz28j14   446     .......N............................................-.......  388

c03f0001   354613  ATGGTGCGACGATAGCAGCGAGAATTCTGAAAGATCGTGCGCTTTTTGCGGAATGGGAAA  354672
rsz59b15   419     ............................................................  360
rsz40k05   419     ............................................................  360
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rsz57k14   403     ............................................................  344
rsz44o16   417     .......................................................A....  358
rsz11m23   395     ............................................................  336
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rsz59b10   421     ............................................................  362
rsz9b09    421     ............................................................  362
rsz53c21   419     .....................................................C......  360
rsz15p02   394     ............................................................  335
rsz70c20   404     ............................................................  345
rsz6j03    403     ............................................................  344
rsz98n05   394     ............................................................  335
rsz31a22   408     ............................................................  349
rsz58o07   395     ............................................................  336
rsz72n19   419     ............................................................  360
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rsz36e02   401     ..............................G.............................  342
rsz38f11   392     ............................................................  333
rsz6f04    389     ............................................................  330
rsz34d08   415     ............................................................  356
rsz86a10   417     ............................................................  358
rsz4p01    418     ................G...........................................  359
rsz61n18   418     ............................................................  359
rsz81o13   411     ............................................................  352
rsz76f20   412     ............................................................  353
rsz32o16   409     ............................................................  350
rsz55d19   403     ............................................................  344
rsz93o07   396     ............................................................  337
rsz83f11   421     ............................................................  362
rsz23l01   386     ............................................................  327
rsz18d09   394     ............................................................  335
rsz22c20   385     ............................................................  326
rsz75j15   387     ............................................................  328
rsz63l03   379     .......................G....................................  320
rsz41k19   405     ............................................................  346
rsz22a01   385     ............................................................  326
rsz15e11   364     ............................................................  305
rsz11g03   384     ............................................................  325
rsz28j14   387     ............................................................  328

c03f0001   354673  CCGAAGTGCATGTGATGAGTAGTCGTATTCTACGCATGCGTCGTGAGCTCTTTGAGGCGC  354732
rsz59b15   359     ............................................................  300
rsz40k05   359     ............................................................  300
rsz26d13   342     ............................................................  283
rsz15e13   359     .........................A..................................  300
rsz43i02   340     ............................................................  281
rsz14e11   344     ............................................................  285
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rsz44o16   357     ............................................................  298
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rsz18d09   36      .............-....-......-.....N.......                       1
rsz22c20   26      .-...........-N...-......-....                                1
rsz75j15   28      .............-N...-......-.....                               1
rsz63l03   22      .........-...-.N..--.....-.                                   1
rsz41k19   47      .............-....-......-.....N.......N..N.......            1
rsz22a01   27      .............-T...-......-....                                1
rsz15e11   6       ......                                                        1
rsz11g03   25      .............T....C......                                     1
rsz28j14   28      .............T....-......-....                                1

c03f0001   355024  TACACACTGGTTTGGTGTTTTGCCACACGGCAACGGAACGAAGCACCGTTCCCGTCACGT  355083
rsz59b15   7       .......                                                       1
rsz40k05   7       .......                                                       1
rsz15e13   5       .....                                                         1
rsz44o16   6       ......                                                        1
rsz59b10   10      ........                                                      3
rsz9b09    7       .......                                                       1
rsz53c21   7       .......                                                       1
rsz72n19   7       .......                                                       1
rsz17a04   334     .....N......................................................  275
rsz34d08   5       N....                                                         1
rsz86a10   5       .....                                                         1
rsz4p01    6       ......                                                        1
rsz61n18   5       .....                                                         1
rsz83f11   7       .......                                                       1

c03f0001   355084  CCAGCTAGACCGATCATCAGGTGCCGTGGAGCCATGATTCGTGAACGGATGCGTCGGTTT  355143
rsz17a04   274     ............................................................  215

c03f0001   355144  TGGTTGCCAGCGTCTACAGCAAAGGCGCGTAACGACGCGAGCGAGAGCGTCGACCCTGCA  355203
rsz17a04   214     .......................................................N....  155

c03f0001   355204  TCCCGTGTGTGCACGGGACGTCGCGCGCATCTCAGGTGCCCTGTGGCAGCGAGTACCATG  355263
rsz17a04   154     ............................................................  95

c03f0001   355264  TAGTCAACCCCGAGGACTTGCTCCATAGATCCTAGCCGGTAACGAATACTGCAGTTAGCG  355323
rsz17a04   94      ............................................................  35

c03f0001   355324  CCTTGCGTGGACCACAGCTCGCGTCTGGGAGAAAA  355358
rsz17a04   34      .......-................NC.........  1