Cyanidioschyzon merolae Genome Project

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c09f0003   1724  ATCTTCCT-CGTATTTCTTCGCCATTAG-ATACGAGTGCGGTAAG-ATTCTGGGCTGAAG  1780
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c09f0003   1781  TTTTCAATATTAGTGATGGACCCAACCAAGTATACACCACGCGATACTTTTGAC-GTGAA  1839
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sz61i05    117   ..........................................-.................  175
sz8m08     117   ..........................................-.................  175
sz70o09    117   ..........................................-.................  175
sz38k09    117   ..........................................-.................  175
sz38g12    117   .............T............................-.................  175
sz36b24    117   ..........................................-.................  175
sz95k14    116   ..........................................-.................  174
sz90n16    108   ..........................................-.................  166
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sz22k02    95    ..........................................-.................  153
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sz97d15    132   ..........................................-.................  190
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sz83i19    95    ..                                                            96
sz50p13    117   ..........................................-.................  175
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sz88d02    90    ..........................................-.................  148
sz38c21    108   ..........................................-.................  166
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sz83d24    87    ..........................................-.................  145
sz93n20    117   ..........................................-.................  175
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sz64j05    95    ..........................................-.................  153
sz3l14     106   .....................                                         126
sz20m09    117   ..........................................-.....N...........  175
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sz20d13    95    ..........................................-.................  153
sz74o05    95    ..........................................-.................  153
sz80a19    127   ..........................................-.................  185
sz48c07    122   ..                                                            123
sz75p08    60    ..........................................-........N........  118
sz80g02    146   ............N....................A........-........N........  204
sz87h19    133   ...........................                                   159
sz75h05    69    ............C....................C........-........C........  127

c09f0003   1899  GGCCGCGTGGACCGGTGCTGCTTGAGGACTACCACCTCTTGGAGAA-GCTGGCTAACTTT  1957
sz15a12    165   ..............................................-.............  223
sz30i18    175   ..............................................-.............  233
sz99m19    167   ..............................................-............C  225
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sz9h16     165   ..............................................-.............  223
sz67p01    176   ..............................................-.............  234
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sz24k23    176   ..............................................-.............  234
sz61i05    176   ..............................................-.............  234
sz8m08     176   ..............................................-.............  234
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sz36b24    176   ..............................................-.............  234
sz95k14    175   ..............................................-.............  233
sz90n16    167   ..............................................-.............  225
sz59o09    174   ..............................................-.............  232
sz61d17    176   ..............................................-.............  234
sz87p16    167   ..............................................-.............  225
sz82m01    176   ..............................................-.............  234
sz22k02    154   ..............................................-.............  212
sz98d07    190   ..............................................-.............  248
sz90j19    166   ..............................................-.............  224
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sz20f13    172   ..............................................-.............  230
sz18g05    176   ..............................................-.............  234
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sz87l09    166   ..............................................-.............  224
sz60c24    167   ..............................................-.............  225
sz54e09    183   ..............................................-.............  241
sz8f05     154   ..............................................-.............  212
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sz34l13    172   ..............................................-.............  230
sz29h20    167   ..............................................-.............  225
sz1j02     183   ..............................................-.............  241
sz43k18    176   ..............................................-.............  234
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sz8j02     154   .............................A................-.............  212
sz62n20    174   ..............................................-..........C..  232
sz1l15     184   ..............................................-.............  242
sz76d16    94    ..............................................-.............  152
sz5b10     183   ..............................................-.............  241
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sz65j02    165   ..............................................-.............  223
sz32k22    166   ..............................................-.............  224
sz98c17    183   ..............................................-.............  241
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sz32c01    176   ..............................................-.............  234
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sz6o21     154   ..............................................-.............  212
sz70d10    154   .................................T............-.............  212
sz89f23    167   ..............................................-.............  225
sz45k08    151   ..............................................-.............  209
sz6i18     161   ..............................................-.............  219
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sz97o02    182   ..............................................-.............  240
sz40h15    154   ..............................................-.............  212
sz66o10    140   ..............................................-.............  198
sz97d15    191   ..............................................-.............  249
sz5k22     192   ..............................................-.............  250
sz81i18    184   ........................G.....................-.............  242
sz15k20    167   ..............................................-.............  225
sz30c19    165   ..............................................-.............  223
sz66i18    184   .............................C................-.............  242
sz76g05    100                                 ................-.............  128
sz78a20    167   ..............................................-.............  225
sz29i03    167   ..............................................-.............  225
sz100g05   166   ..............................................-.............  224
sz82h05    175   ................................T.............-.............  233
sz82b12    175   ..............................................-.............  233
sz47l20    168   ..............................................-.............  226
sz83i19    81                                                           .....  85
sz50p13    176   ..............................................-.............  234
sz47f02    167   ..............................................-.............  225
sz84j18    167   ..............................................-.............  225
sz49i01    171   ..............................................-.............  229
sz28c05    176   ..............................................-.............  234
sz88d02    149   ..............................................-.............  207
sz38c21    167   ..............................................-.............  225
sz90o08    154   .......................A......................-.............  212
sz83d24    146   .....T.....................................N..-.............  204
sz93n20    176   ..............................................-.............  234
sz63b22    150   ..............................................-.............  208
sz17l22    117   ..............................................-.............  175
sz64j05    154   ..............................................-.............  212
sz3l14     118                                              ...C.............  134
sz20m09    176   ..............................................-.............  234
sz60i05    151   ..............................................-.............  209
sz20d13    154   ..............................................-.............  212
sz74o05    154   ..............................................-.............  212
sz80a19    186   ..............................................-.............  244
sz48c07    111                                                            ...  113
sz75p08    119   ............................N.................-.............  177
sz80g02    205   .....................................                         241
sz75h05    128   ....                                                          131

c09f0003   1958  GACCGTGAACGGCAACCGGAGCGTGTTGTACACGCGCGCGGTGTGACTGCCAAGGGTTAC  2017
sz15a12    224   ............................................................  283
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sz42m19    226   .....A......................................................  285
sz14o12    214   ............................................................  273
sz4o05     213   ............................................................  272
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sz96j18    224   ............................................................  283
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sz40o22    224   ............................................................  283
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sz38k09    235   ............................................................  294
sz38g12    235   ............................................................  294
sz36b24    235   ............................................................  294
sz95k14    234   ............................................................  293
sz90n16    226   ............................................................  285
sz59o09    233   ............................................................  292
sz61d17    235   ............................................................  294
sz87p16    226   ............................................................  285
sz82m01    235   .....C......................................................  294
sz22k02    213   ............................................................  272
sz98d07    249   ............................................................  308
sz90j19    225   ............................................................  284
sz77k10    226   ............................................................  285
sz20f13    231   ............................................................  290
sz18g05    235   ............................................................  294
sz89h15    235   ............................................................  294
sz87l09    225   ............................................................  284
sz60c24    226   ............................................................  285
sz54e09    242   ............................................................  301
sz8f05     213   ............................................................  272
sz100d22   226   ............................................................  285
sz66i20    226   ............................................................  285
sz58c10    226   ............................................................  285
sz54c17    243   ............................................................  302
sz34l13    231   ............................................................  290
sz29h20    226   ............................................................  285
sz1j02     242   ............................................................  301
sz43k18    235   ............................................................  294
sz36p22    226   ............................................................  285
sz35a03    226   ............................................................  285
sz19f13    226   ............................................................  285
sz8j02     213   ............................................................  272
sz62n20    233   ............................................................  292
sz1l15     243   ............................................................  302
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sz5b10     242   ............................................................  301
sz71e19    226   ............................................................  285
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sz98c17    242   ............................................................  301
sz34c22    225   ............................................................  284
sz32c01    235   ............................................................  294
sz49a07    213   ............................................................  272
sz6o21     213   ............................................................  272
sz70d10    213   ............................................................  272
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sz18g05    415   ............................................................  474
sz89h15    415   ............................................................  474
sz87l09    405   ............................................................  464
sz60c24    406   ............................................................  465
sz54e09    422   ............................................................  481
sz8f05     393   ............................................................  452
sz100d22   406   ............................................................  465
sz66i20    406   ............................................................  465
sz58c10    406   ............................................................  465
sz54c17    423   ............................................................  482
sz34l13    411   ............................................................  470
sz29h20    406   ............................................................  465
sz1j02     422   ............................................................  481
sz43k18    415   ............................................................  474
sz36p22    406   ...C........................................................  465
sz35a03    406   ............................................................  465
sz19f13    406   ............................................................  465
sz8j02     393   ............................................................  452
sz62n20    413   ............................................................  472
sz1l15     423   ............................................................  482
sz76d16    333   ............................................................  392
sz5b10     421   ............................................................  480
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sz98c17    422   ............................................................  481
sz34c22    405   .................................C..........................  464
sz32c01    415   ............................................................  474
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sz6o21     393   ............................................................  452
sz70d10    393   ...............................G............................  452
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sz47f02    406   ............................................................  465
sz84j18    406   ............................................................  465
sz49i01    410   ............................................................  469
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sz38c21    406   ............................................................  465
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sz63b22    389   ...................................................           439
sz17l22    356   ............................................................  415
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sz3l14     315   ............................................................  374
sz20m09    415   ............                                                  426
sz60i05    390   .......................                                       412
sz68e02    205   ............................................................  264
sz48c07    293   ...........................................................   351
sz83g14    42    ............................................................  101
sz71b05    235   ............                                                  246

c09f0003   2198  CTCGTCGGAAATAATCTGCCGGTCTTCTTTATCAGGGATGCGATCAAGTT-CCCGGACTT  2256
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sz30i18    474   ...A..............................................-.........  532
sz99m19    466   ..................................................-.........  524
sz42m19    466   ..................................................-.........  524
sz14o12    454   ..................................................-.........  512
sz4o05     453   ..................................................-.........  511
sz8i08     453   ..................................................-.........  511
sz42o13    453   ..................................................-.........  511
sz96j18    464   ....................................A.............-.........  522
sz26m12    493   ..................................................-.........  551
sz40o22    464   ..................................................-.........  522
sz11f07    475   ..................................................-.........  533
sz29i16    466   ..................................................-.........  524
sz73a10    453   ..................................................-.........  511
sz9h16     464   ..................................................-.........  522
sz67p01    475   ..................................................-.........  533
sz55k14    475   ..................................................-.........  533
sz24k23    475   ..................................................-.........  533
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sz95k14    474   ..................................................-.........  532
sz90n16    466   ..................................................-.........  524
sz59o09    473   ..................................................-.........  531
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sz98d07    489   ..................................................-.........  547
sz90j19    465   ..................................................-.........  523
sz77k10    466   ..................................................-.........  524
sz20f13    471   ..................................................-.........  529
sz18g05    475   ..................................................-.........  533
sz89h15    475   ..................................................-.........  533
sz87l09    465   ..................................................-.........  523
sz60c24    466   ..................................................-.........  524
sz54e09    482   ..................................................-.........  540
sz8f05     453   ..................................................-.........  511
sz100d22   466   ..................................................-.........  524
sz66i20    466   ..................................................-.........  524
sz58c10    466   ..................................................-.........  524
sz54c17    483   ..................................................-.........  541
sz34l13    471   ..................................N...............-.........  529
sz29h20    466   ..................................................-.........  524
sz1j02     482   ..................................................-.........  540
sz43k18    475   ..................................................-.........  533
sz36p22    466   ..................................................-.........  524
sz35a03    466   ................................T.................-.........  524
sz19f13    466   ..................................................-.........  524
sz8j02     453   ..................................................-.........  511
sz62n20    473   ..................................................-.........  531
sz1l15     483   ..................................................-.........  541
sz76d16    393   ..................................................-.........  451
sz5b10     481   ..................................................-.........  539
sz71e19    466   ..................................................-.........  524
sz65j02    464   ..................................................-........C  522
sz32k22    465   ..................................................-.........  523
sz98c17    482   ..................................................-.........  540
sz34c22    465   ..................................................-.........  523
sz32c01    475   ..................................................C.........  534
sz49a07    453   ..................................................-.........  511
sz6o21     453   ..................................................-.........  511
sz70d10    453   ..................................................-.........  511
sz89f23    466   ..................................................-.........  524
sz45k08    450   ..................................................-.........  508
sz6i18     460   ..................................................-.........  518
sz50a04    453   ..................................................-.........  511
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sz40h15    453   ..................................................-.........  511
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sz97d15    490   ..................................................            539
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sz81i18    483   ..................................................-......     538
sz15k20    466   ..................................................-..         517
sz30c19    464   ..................................................-....       517
sz66i18    483   .................................................             531
sz76g05    369   ..................................................-.........  427
sz78a20    466   ...................................                           500
sz29i03    466   ..................................                            499
sz100g05   465   ..................................                            498
sz82h05    474   ......N..........................                             506
sz82b12    474   ......................                                        495
sz47l20    467   ............................                                  494
sz83i19    326   ..................................................-.........  384
sz50p13    475   ..........                                                    484
sz47f02    466   .....................                                         486
sz84j18    466   .................                                             482
sz49i01    470   ...................                                           488
sz28c05    475   ....                                                          478
sz88d02    448   .............................                                 476
sz38c21    466   .......                                                       472
sz90o08    453   .................                                             469
sz83d24    445   ...                                                           447
sz17l22    416   .................                                             432
sz64j05    426                           ..........................C.........  461
sz3l14     375   ..................................................-.....G...  433
sz68e02    265   ..................................N...............-.........  323
sz83g14    102   ..................................................-.........  160

c09f0003   2257  AATTCACGCGTTCAAACCAAACCCGCGGACAGAGGCGCAGGAATCCTGGAGGATTCTCGA  2316
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sz99m19    525   ............................................................  584
sz42m19    525   ............................................................  584
sz14o12    513   ............................................................  572
sz4o05     512   ............................................................  571
sz8i08     512   ............................................................  571
sz42o13    512   .........................................G..................  571
sz96j18    523   ............................................................  582
sz26m12    552   ............................................................  611
sz40o22    523   ............................................................  582
sz11f07    534   ...............................................               580
sz29i16    525   ...................................................           575
sz73a10    512   .....................................................         564
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sz22k02    512   ...........................................                   554
sz98d07    548   ....................                                          567
sz90j19    524   ..............................                                553
sz77k10    525   .............................                                 553
sz20f13    530   .............................                                 558
sz18g05    534   .......................                                       556
sz89h15    534   .................T.......                                     558
sz87l09    524   .............................                                 552
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sz54e09    541   ...............................                               571
sz8f05     512   ............................................                  555
sz100d22   525   ...........................                                   551
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sz58c10    525   ...........................                                   551
sz54c17    542   ..............................                                571
sz34l13    530   .............................                                 558
sz29h20    525   ...........................                                   551
sz1j02     541   ..............................                                570
sz43k18    534   .................                                             550
sz36p22    525   .............................                                 553
sz35a03    525   ................................                              556
sz19f13    525   .............................                                 553
sz8j02     512   .............................................                 556
sz62n20    532   ............................                                  559
sz1l15     542   ..............................                                571
sz76d16    452   ............................................................  511
sz5b10     540   ...........................                                   566
sz71e19    525   ..........................                                    550
sz65j02    523   ...........................                                   549
sz32k22    524   ...........................                                   550
sz98c17    541   ......................                                        562
sz34c22    524   ............................                                  551
sz32c01    535   ...................                                           553
sz49a07    512   ..............................                                541
sz6o21     512   ..............................                                541
sz70d10    512   ...................................                           546
sz89f23    525   .................                                             541
sz45k08    509   ..............................                                538
sz6i18     519   ...................                                           537
sz50a04    512   ..............................                                541
sz97o02    540   .............                                                 552
sz40h15    512   ........................                                      535
sz66o10    498   ..............................                                527
sz76g05    428   ............................................................  487
sz83i19    385   ............................................................  444
sz64j05    462   ..........................                                    487
sz3l14     434   ............................................................  493
sz68e02    324   ..........C.................................................  383
sz83g14    161   .............................                                 189

c09f0003   2317  CTTTTTAAGCAACCAACACGAAAGCCTGAATATGCTCACGTTCCTTTTCGACGACGAGGG  2376
sz15a12    583   ....................................................          634
sz30i18    593   ..................................................            642
sz99m19    585   ...................................................           635
sz42m19    585   .....................................................         637
sz14o12    573   .......................................................       627
sz4o05     572   ......................................................        625
sz8i08     572   .....................................................         624
sz42o13    572   ......................................................        625
sz96j18    583   .....................................................         635
sz26m12    612   ...                                                           614
sz76d16    512   ..........................C..............................     568
sz76g05    488   .G..........................................................  547
sz83i19    445   ............................................................  504
sz3l14     494   ............................................................  553
sz68e02    384   ..............................................                429

c09f0003   2377  TATCCCGAAGGACTATCGGCATATGCGCGGCAGCGGAGTGCACTCGTTCCGCCTTGTAAC  2436
rsz90n16   717                                                            ...  715
sz76g05    548   ...........................................................   606
sz83i19    505   ............................................................  564
sz63b22    434         ......................................................  487

c09f0003   2437  CAGGGACGGACGCTCGACGTACGTGCGCTTCCACTGGCGCCCCAAGTGCGGTATGGAAAA  2496
rsz90n16   714   ............................................................  655
rsz24k23   761   ............................................................  702
rsz98d07   716             ..................................................  667
rsz17l22   713               ................................................  666
sz83i19    565   ..                                                            566
sz63b22    488   ............................................................  547

c09f0003   2497  CTTGTTGGACGAAGAGGCTGCCGTTGTGTGTGGTCAGGATTTTTCTCACGCAACGCATGA  2556
rsz90n16   654   .....A......................................................  595
rsz24k23   701   ............................................................  642
rsz98d07   666   ............................................................  607
rsz17l22   665   ............................................................  606
sz63b22    548   ............................................................  607

c09f0003   2557  CTTGATCCGGGCAATTGACCGAGGCGACTATCCCGAATGGGCGCTCTATATCCAAACCAT  2616
rsz42m19   744               ................................................  697
rsz97o02   715                                              .................  699
rsz90n16   594   .........                                                     586
rsz24k23   641   ............................................................  582
rsz98d07   606   ............................................................  547
rsz17l22   605   ............................................................  546
sz63b22    608   ................                                              623

c09f0003   2617  GGACCCGGCAATGGTTGAGAACCACGTGTTCCCGTGGGGCGATCCACTCGACGCGACGAG  2676
rsz73a10   724                                       ........................  701
rsz42m19   696   ............................................................  637
rsz97o02   698   ............................................................  639
rsz24k23   581   .........                                                     573
rsz98d07   546   ............................................................  487
rsz17l22   545   ............................................................  486
rsz3l14    611   ................................................N...........  552

c09f0003   2677  AGAGTGGCCTGAGAAGGACTTTCCGCTTCGCCCTGTGGGTCGCATGGTGCTGAATCAGAA  2736
rsz73a10   700   ............................................................  641
rsz61i05   682                     ..........................................  641
rsz42m19   636   ................                                              621
rsz97o02   638   ................                                              623
rsz98d07   486   ............................................................  427
rsz17l22   485   ............................................................  426
rsz3l14    551   ........N................N.......................N..........  492
rsz76n09   641              .................................................  593

c09f0003   2737  CTGCGATAACCAGTTCTTGGAGAATGAGCAAATTGCCTTCTCGCCGGCACTCGTTGTCCC  2796
rsz42o13   803                                                          .....  799
rsz73a10   640   ............................................................  581
rsz61i05   640   ............................................................  581
rsz98d07   426   ............................................................  367
rsz17l22   425   ............................................................  366
rsz3l14    491   ............................................................  432
rsz76n09   592   ............................................................  533

c09f0003   2797  AGGTATCTACTATTCAGACGATAAGCTGTTGCAGGGTCGCCTTTTCAGTTACGCC-GACA  2855
rsz42o13   798   .......................................................-....  740
rsz26m12   792         ..................................N..............-....  740
rsz5b10    787              ............................................-....  740
rsz92g11   779                     .....................................-....  739
rsz88d02   786              ............................................-....  739
rsz89f23   786              ............................................-....  739
rsz58c10   785               ...........................................-....  739
rsz5k22    788           ...............................................-....  738
rsz14o12   778                       ...................................-....  740
rsz82b12   784              ............................................-....  737
rsz55k14   774                         .................................-....  738
rsz71b05   765                                    ......................-....  740
rsz59o09   758                                           ..............N-....  740
rsz82m01   759                                         .................-....  739
rsz8j02    762                                        ..................-....  741
rsz15k20   768                              ............................-....  737
rsz1l15    757                                            ..............-....  740
rsz30i18   760                                       ...................-....  738
rsz9h16    756                                             .............-....  740
rsz98c17   754                                               ...........-....  740
rsz90o08   756                                             .............-....  740
rsz70o09   754                                               ...........-....  740
rsz97d15   756                                             .............-....  740
rsz60c24   757                                          ................-....  738
rsz11f07   755                                             .............-....  739
rsz36b24   759                                          ................N....  739
rsz38k09   754                                            ..............-....  737
rsz89h15   754                                             .............-....  738
rsz36k23   755                                             .............-....  739
rsz84j18   754                                             .............-....  738
rsz82h05   753                                              ............-....  738
rsz76d16   748                                                     .....-....  740
rsz75p08   756                                            .......-......-....  740
rsz29h20   753                                              ............-....  738
rsz64j05   753                             ..............N..............-....  721
rsz32c01   751                                                  ........-....  740
rsz87h19   751                                                ..........-....  738
rsz77k10   746                                                       ...-....  740
rsz70d10   754                                               ...........-....  740
rsz15a12   752                                                ..........-....  739
rsz86f23   753                                               ...........-....  739
rsz15h10   755                                           ...............-....  737
rsz6i18    748                                                    ......-....  739
rsz96j18   752                                                ..........-....  739
rsz65j02   751                                               ...........-....  737
rsz100g05  748                                                   .......-....  738
rsz40o22   744                                                       ...-....  738
rsz37h18   753                                             .............-....  737
rsz99m19   744                                                         .-....  740
rsz34c22   755                                            ..............-....  738
rsz60i05   756                                      ....................-....  733
rsz61d17   741                                                            ...  739
rsz32k22   751                                            ..............-....  734
rsz67p01   744                                                       ..N-....  738
rsz93n20   745                                                    ......-....  736
rsz80g02   741                                                            ...  739
rsz75h05   748                                                     .....-....  740
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rsz80p21   739                                                              .  739
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c09f0003   3153  ACCGGATCGCGAAACTGCTAACAGATGAGCGCG-TGACCCCAGA-GCTGCGAGCCATCTG  3210
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c09f0003   3271  GCAGTGTACAATGTGAATgtcgtt-gtcgtcgtcgttgtcgtcgtcgtcgCTGTGCG-CT  3328
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rsz82m01   323   ........................-................................-..  266
rsz8j02    325   ........................-................................-..  268
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c09f0003   3389  ATAGCCGCTGCAACCATATGAC-GGGGCTG-GGTGCGCATCTCCGGCAAAGCGTGTTGAC  3446
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rsz76d16   206   ......................-.......-.............................  149
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rsz29h20   204   ......................-.......-.............................  147
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rsz70d10   206   ......................-.......-.............A...G...........  149
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rsz15h10   203   ......................-.......-.............................  146
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c09f0003   3561  G-AATGG-GTGTTTTT-CG-GT-TTGTTTAAACAGAACGCTGATCGGTTTCCACGTGTCG  3615
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rsz78a20   29    .-..N..-N.-....--..-..-.-...N..-......                        1
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rsz8m08    34    .-.....-..-.....-..-.--.................                      2
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rsz24k23   33    .-G....-..-.....-..-..-.N-..-...........                      2
rsz83d24   18    .T.....-........-..-.                                         1
rsz98d07   33    .-.....-..-.....-..-..-.-...-...........                      2
rsz17l22   34    .-.....-.N-.....-..-.--.................                      2
rsz19f13   20    .N.....-........-..-..-.                                      1
rsz83i19   33    .-.....-..-.....-..-.--.................                      1
rsz54c17   14    .-.....-........                                              1
rsz94e02   12    .-.....-..-....                                               1
rsz28c05   33    .C.....C........N..C..A..........                             1
rsz76n09   6     .-.....                                                       1
rsz74o05   34    .-.....-........-..-..-.N-..............                      1
rsz50a04   144   .-.....-........-..-..-.....................................  90
rsz44n07   35    .-.....-..-.....-..-.--.................                      3

c09f0003   3616  CGCCCTAGCATGATCCGAAACGaccgccgccgccaccgccaccgccaccaccaccaccac  3675
rsz50a04   89    ............................................................  30

c09f0003   3676  ggtgacggccataaccaccaTCGTAAACACAAG  3708
rsz50a04   29    ..N-.......-.........-.N..-......  1